Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm438B1ASB3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms