Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik3B1AS29 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grik3B1AS29 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Grik3B1AS29 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Grik3B1AS29 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms