Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prr29B1ARI9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prr29B1ARI9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prr29B1ARI9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms