Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprsB0V2N1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprsB0V2N1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms