Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem238A9JSM3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms