Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Skint5A7XUY5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Skint5A7XUY5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms