Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herc3A6H6S0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herc3A6H6S0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms