Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc9bA3KGF9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc9bA3KGF9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc9bA3KGF9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms