Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5640A3KG49 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5640A3KG49 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5640A3KG49 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5640A3KG49 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5640A3KG49 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5640A3KG49 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms