Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Htra4A2RT60 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Htra4A2RT60 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms