Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Upf2A2AT37 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Upf2A2AT37 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Upf2A2AT37 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms