Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramef25A2ASI9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms