Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SktA2AQ25 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SktA2AQ25 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SktA2AQ25 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SktA2AQ25 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SktA2AQ25 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SktA2AQ25 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SktA2AQ25 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SktA2AQ25 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SktA2AQ25 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SktA2AQ25 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SktA2AQ25 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SktA2AQ25 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms