Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rtf1A2AQ19 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Rtf1A2AQ19 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rtf1A2AQ19 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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