Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syndig1A2ANU3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Syndig1A2ANU3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms