Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GabreA2AMW3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms