Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zkscan16A2ALW2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zkscan16A2ALW2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zkscan16A2ALW2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zkscan16A2ALW2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zkscan16A2ALW2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zkscan16A2ALW2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms