Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc183A2AJB1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc183A2AJB1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms