Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VirmaA2AIV2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VirmaA2AIV2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VirmaA2AIV2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms