Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramel3A2AHA7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pramel3A2AHA7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pramel3A2AHA7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms