Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyb561d1A2AE42 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyb561d1A2AE42 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms