Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700023F06RikA2AB62 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
1700023F06RikA2AB62 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms