Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprfA2A8L5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprfA2A8L5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms