Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1bA1Z198 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nlrp1bA1Z198 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nlrp1bA1Z198 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms