Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc112A0AUP1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc112A0AUP1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms