Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms