Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tlr5Q9JLF7 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms