Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 1700010K24Rik-201ENSMUST00000125852 226 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm32098-201ENSMUST00000211305 479 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
OtofQ9ESF1 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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