Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Dab2-202ENSMUST00000080880 4663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Sfmbt1-202ENSMUST00000112184 2936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ccdc97Q9DBT3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ccdc97Q9DBT3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ccdc97Q9DBT3 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ccdc97Q9DBT3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ccdc97Q9DBT3 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Dhx32-202ENSMUST00000063669 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc97Q9DBT3 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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