Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atg3Q9CPX6 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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