Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rdh13Q8CEE7 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms