Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7R2

Gm3411, Predicted gene 3411, mousemouse

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3411Q8C7R2 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm3411Q8C7R2 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm3411Q8C7R2 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm3411Q8C7R2 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3411Q8C7R2 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms