Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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