Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Dsg1bQ7TSF1 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1bQ7TSF1 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Dsg1bQ7TSF1 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 338.1 ms