Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rad54bQ6PFE3 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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