Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm17910-201ENSMUST00000211038 838 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm22906-201ENSMUST00000175191 250 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpusd2Q149F1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms