Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Siah1bQ06985 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms