Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Adcy4-202ENSMUST00000170223 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Wdr95-201ENSMUST00000110502 2482 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Irx2P81066 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irx2P81066 St7-201ENSMUST00000000674 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Ttc41-205ENSMUST00000219108 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Unc93a-201ENSMUST00000084966 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gigyf2-205ENSMUST00000172794 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gsdmc2-201ENSMUST00000089900 1981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Homer1-204ENSMUST00000102752 5713 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Rimbp2-202ENSMUST00000196085 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Clec4f-201ENSMUST00000014686 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gfpt1-201ENSMUST00000032057 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 9630001P10Rik-202ENSMUST00000181335 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Epb41l3-215ENSMUST00000225977 3188 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Hinfp-205ENSMUST00000216508 5333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm37350-201ENSMUST00000192782 313 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Zfp169-201ENSMUST00000110110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm10824-201ENSMUST00000220000 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Nipal4-201ENSMUST00000020679 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Smim7-203ENSMUST00000167290 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Trim43a-201ENSMUST00000164661 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gpkow-201ENSMUST00000049896 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Hmgcr-209ENSMUST00000170287 2981 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Srsf7-201ENSMUST00000063417 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Cd22-203ENSMUST00000186154 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Itm2a-201ENSMUST00000033591 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Tagap-201ENSMUST00000036370 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm19611-201ENSMUST00000216401 1865 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Irx2P81066 B020018J22Rik-201ENSMUST00000223085 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Slc30a2-204ENSMUST00000105874 3153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm37813-201ENSMUST00000195003 3695 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Olfr749-202ENSMUST00000214290 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Dad1-202ENSMUST00000128231 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Ctbp2-214ENSMUST00000169570 3604 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Itgbl1-201ENSMUST00000049681 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Kpna7-201ENSMUST00000110672 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm7882-201ENSMUST00000177915 1762 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Rcbtb2-209ENSMUST00000164822 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 AC162934.2-201ENSMUST00000221451 249 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Irx2P81066 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms