Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Stxbp5l-206ENSMUST00000114787 4394 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms