Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Zfp677-201ENSMUST00000056107 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Sh3bp1P55194 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
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