Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa8P50706 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Recql5os1-201ENSMUST00000134391 396 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa8P50706 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms