Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtpreP49446 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PtpreP49446 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtpreP49446 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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PtpreP49446 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtpreP49446 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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