Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 AI463170-201ENSMUST00000217839 970 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rpl28P41105 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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