Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm8603-201ENSMUST00000115649 1515 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ccnb1ip1-201ENSMUST00000095932 1509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm36670-202ENSMUST00000210400 1405 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ptprr-207ENSMUST00000155606 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ms4a3-201ENSMUST00000112984 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm18513-201ENSMUST00000177313 560 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm27283-201ENSMUST00000184853 323 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 1700019P21Rik-201ENSMUST00000186955 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm38132-201ENSMUST00000193358 707 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 D830044I16Rik-205ENSMUST00000206296 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Rcvrn-201ENSMUST00000021290 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 AC137127.2-201ENSMUST00000215086 935 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Ces2a-204ENSMUST00000164182 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm23659-201ENSMUST00000102245 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm11224-201ENSMUST00000120465 1111 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20924-201ENSMUST00000177663 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20816-201ENSMUST00000177765 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20909-201ENSMUST00000178234 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20825-202ENSMUST00000178396 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20852-201ENSMUST00000178761 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20867-201ENSMUST00000178900 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm21443-201ENSMUST00000179070 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20747-201ENSMUST00000179137 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PtprmP28828 Gm21783-201ENSMUST00000179570 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm21812-201ENSMUST00000179590 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm21721-201ENSMUST00000179595 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20809-201ENSMUST00000179663 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm21118-201ENSMUST00000180179 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm22347-201ENSMUST00000180276 132 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20806-201ENSMUST00000180324 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20909-202ENSMUST00000181205 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm15645-202ENSMUST00000183393 1299 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm8982-201ENSMUST00000184198 1295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20907-201ENSMUST00000185201 693 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20919-201ENSMUST00000185282 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm21785-201ENSMUST00000185440 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm21808-201ENSMUST00000185495 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20898-201ENSMUST00000185598 693 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20800-201ENSMUST00000185634 693 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20902-201ENSMUST00000185643 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm21268-201ENSMUST00000185646 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm21257-201ENSMUST00000185655 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm21733-201ENSMUST00000185670 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm29075-201ENSMUST00000185717 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20889-201ENSMUST00000185749 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm28273-201ENSMUST00000185811 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprmP28828 Gm20799-201ENSMUST00000185833 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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