Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ifnb1P01575 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.4 ms