Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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Ccl20O89093 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ccl20O89093 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
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