Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms