Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ScaperF8VQ70 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ScaperF8VQ70 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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