Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RhoaQ9QUI0 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms