Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm26356-201ENSMUST00000158217 283 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
OtofQ9ESF1 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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